История кафедры Автоматики и вычислительной техники в Государственной морской академии имени адмирала С.О.Макарова начинается с 1957 года, когда была создана лаборатория для создания первой в нашей стране навигационной вычислительной машины. В 1962 году эта машина была создана, а на базе лаборатории была образована первая в морских Вузах страны кафедра Автоматики и вычислительной техники. Почти все ее разработчики и стали членами кафедры. Это время следует считать и началом становления научной школы- кафедры.

Основателем лаборатории, кафедры и научной школы в области автоматизации судовождения был Сазонов Анатолий Ефимович , который до 1997 года и руководил кафедрой. В 1991 году он был избран Членом-корреспондентом Российской Академии наук.  В настоящее время он продолжает работать профессором кафедры. С 1997 года кафедру возглавляет бывший аспирант и докторант кафедры, ныне профессор, доктор технических наук Сергей Викторович Смоленцев , известный специалист в области  использования информационных технологий для обработки навигационных измерений. Особый научный интерес представляют его последние работы в области использования интеллектуальных систем оценки ситуации и управления на основе динамических семантических сетей. Под его научным руководством были разработаны и внедрены несколько информационно- поисковых систем.

К наиболее крупным достижениям кафедры следует отнести работы профессора Филиппова Ю.М., который в нашей стране является основателем научной школы в области последовательной обработки навигационных измерений . Это направление за рубежом носит название "последовательная навигация". Первым автором вероятностной интерпретации задачи расхождения судов по праву считается профессор кафедры Родионов А.И.

В инженерной области из крупных выполненных на кафедре работ, помимо навигационной вычислительной машины, следует назвать  разработанный, построенный и переданный в эксплуатацию первый тренажер по управлению атомной силовой установкой ледокола "Ленин". Для его создания при кафедре была создана специальная проблемная лаборатория. Большое участие в ее создание принимал инженер Чирков В.А.

Научная работа на кафедре в  настоящее время направлена на разработку новых методов алгоритмического и программного обеспечения систем автоматизации судовождения в том числе и с использованием современных информационных технологий (семантические сети, нейротехнологии, нечеткие множества, экспертные системы и др.). Большой интерес представляют выполненные  на кафедре в 2005 году работы в области влияния человеческого фактора на безопасность судна, следствием которых явилась разработанная и переданная в эксплуатацию экспертная система для самооценки систем управления безопасностью судоходных компаний. 
Основные научные достижения кафедры, в том числе и последних лет, относятся к работам в области теории методов обработки навигационной информации, комплексирования навигационных измерений, построения имитационных моделей судов, интеллектуальных систем оценки ситуаций.

С момента образования научной школы кафедры сотрудниками , аспирантами и докторантами кафедры защищено 10 докторских и 78 кандидатских диссертаций из которых 9 защищены иностранными специалистами.

С момента своего создания кафедра ведет преподавание как основных профилирующих дисциплин на Радиотехническом факультете ( Радиоавтоматика, Электронные вычислительные машины и полный цикл дисциплин в области информационных технологий).На Судоводительском факультете кафедра ведет дисциплину "Автоматизация судовождения" . На всех без исключения факультетах кафедра обеспечивает преподавание дисциплины "Информатика" . Для аспирантов  кафедрой читаются курсы лекций по дисциплинам в области информационных технологий.

Быстрое развитие информационных технологий во второй половине 20 века и в настоящее время потребовали от кафедры непрерывного обновления содержания преподаваемых дисциплин и подготовки учебных пособий. Это стало возможным благодаря сочетанию на кафедре научной и учебной работы. Высокая квалификация, как работавших в разное время на кафедре профессоров Филиппова Ю.М.,Родионова А.И., доцентов Баскакова В.Ф., Булгакова Б.Л..Мальшакова Г.М., Лугинина В.Д., так и работающих в настоящее время профессора Иванова В.Ю. , доцентов Кузина З.С., Никифорова Ю.Ф. , Приказчикова М.М. , Волкова А.Л. Криворотова В.В, Клименко Г.В., старшего преподавателя Фомина Д.Н.,  позволяла и позволяет успешно справляться с этой задачей.

На современном этапе развития информационных технологий кафедра Автоматики и вычислительной техники остается научным и учебным подразделением Радиотехнического факультета , обеспечивающим научную работу и учебный процесс, которые отвечают требованиям времени.